Во АКН, организационата поставеност е утврдена на следниве нивоа:
- Директор;
- Заменик-директор;
- Државни советници;
- Раководители на секторите;
- Помошници-раководители на секторите;
- Раководители на одделенија;
Според видот, обемот, сложеноста и меѓусебната сродност и поврзаност, АКН е сочинета од следниве организациски структури:
Генералната дирекција на Агенцијата за катастар на недвижности, е сочинета од:
- Сектори;
- Одделенија;
- Самостојно одделение за внатрешна ревизија;
Центарот за катастар на недвижности – Скопје, е сочинет од:
- Сектори;
- Одделенија;
